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研究揭示麥類(lèi)特異轉座子重塑小麥環(huán)境適應的調控網(wǎng)絡(luò )

來(lái)源:鄭州天順食品添加劑有限公司 發(fā)布時(shí)間:2021-09-17 12:52:11 關(guān)注: 0 次
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  轉座子(Transposable Element,TE)是基因中可運動(dòng)的DNA元器件。麥子族種群的轉座子展現爆發(fā)式提高,基因達到3-16 Gb,85%之上由TE構成,而與之親緣關(guān)系緊密的二穗細柄草基因僅有272 Mb??梢哉f(shuō)麥子的遺傳基因是“撒落”在TE的大海中,那麼這種TE人群只是是自身拷貝廢棄物編碼序列,依然會(huì )危害寄主的遺傳基因活力與適應能力呢?
  中科院基因遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究室研究者薛勇彪課題組、復旦研究者張一婧課題組與中國科學(xué)院分子結構綠色植物科學(xué)研究非凡創(chuàng )新中心/上海市綠色植物挫折分子生物學(xué)研究所研究者朗曌博課題組和南京農大專(zhuān)家教授劉文利課題組運用DNA親和力提純轉錄組測序(DAP-seq)技術(shù)性得到53個(gè)自然環(huán)境回應轉錄因子的全基因高品質(zhì)融合圖普(圖A),發(fā)覺(jué)達到85%轉錄因子融合結構域(Transcription Factor Binding Sites,TFBS)坐落于TE內部(TE-embedded TFBS)。根據與TE內部TFBS較為,研究發(fā)現1/4非TE區TFBS(nonTE-TFBS)很有可能來(lái)自TE-embedded TFBS,而且是麥子族特異性發(fā)生的管控編碼序列,進(jìn)一步適用這種非TE管控區是隨著(zhù)麥子族TE暴發(fā)發(fā)源的。TE-embedded TFBS和TE來(lái)源于TFBS(TE-derived TFB)關(guān)鍵由好多個(gè)特殊LTR反轉錄轉座子亞大家族奉獻,表明這幾種TE亞大家族的重復和轉座非特異參加了麥子的遺傳基因管控互聯(lián)網(wǎng)。伴隨著(zhù)TE-derived TFBS編碼序列與TE編碼序列分裂時(shí)間越長(cháng),其活力越高,與遺傳基因的間距也越近,因此,TE有可能為T(mén)FBS演變給予了普遍的編碼序列基本(圖B)。除此之外,根據與稻谷挫折回應遺傳基因較為發(fā)覺(jué),麥子非特異挫折回應遺傳基因明顯聚集在TE-derived TFBS的靶遺傳基因中,表明麥子非特異的TE亞大家族參加了麥子基因表達管控互聯(lián)網(wǎng)的重構及麥子的適應能力演變(圖C)。
  有關(guān)研究結論于9月9日線(xiàn)上發(fā)布在Genome Research上??茖W(xué)研究工作中獲得自然科學(xué)基金杰出青年科學(xué)研究國家社科基金和中國科學(xué)院戰略主導高新科技重點(diǎn)的支助。
  麥子特異性轉座子重構麥子自然環(huán)境適用的管控互聯(lián)網(wǎng)

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